Το 1985, η Ελληνική Πολιτεία -με Προεδρικό Διάταγμα- ανακήρυξε το Απολιθωμένο Δάσος σε Διατηρητέο Μνημείο της Φύσης, με άμεσο στόχο την ορθή διαχείριση και προστασία του. Το 1994 δημιουργήθηκε ένα υπερσύγχρονο Μουσείο, με σκοπό την περαιτέρω συστηματική και επιστημονική μελέτη, έρευνα, ανάδειξη και συντήρησή του. Το κτίριο του Μουσείου κατασκευάστηκε με απόλυτο σεβασμό στο φυσικό περιβάλλον, με λιθοδομή από γκρίζα λάβα, κυρίαρχο υλικό της περιοχής.

Πρόσφατα, δίπλα στις εγκαταστάσεις του Μουσείου, δημιουργήθηκε το Γεωπάρκο Απολιθωμένου Δάσους, όπου εξαιρετικής σημασίας απολιθωμένοι κορμοί έχουν τοποθετηθεί σε κατάλληλα διαμορφωμένο χώρο για την εύκολη πρόσβαση των επισκεπτών. Το πιο σημαντικό εύρημα του Γεωπάρκου είναι οι ρίζες των απολιθωμένων δέντρων.

`Έχει αποκαλυφθεί το ριζικό σύστημα πολλών δένδρων σε πλήρη ανάπτυξη, ενώ εντυπωσιακοί όρθιοι κορμοί, με μοναδικά χρώματα, ξεπροβάλλουν από τα στρώματα της ηφαιστειακής στάχτης που τα περιβάλλει.